原爆放射能医学研究所は，昭和36年に「原子爆弾の放射能による障害の治療及び予防に関する学理並びにその応用の研究」を目的として，開設された。
平成6年の改組を経て，平成14年度に改組・再編し，名称を「原爆放射線医科学研究所」と改称するとともに，その目的を「原子爆弾その他の放射線による障害の治療及び予防に関する学理並びにその応用の研究」へと変更した。
平成22年の改組・再編により2附属施設で組織しており，2大研究部門，2大研究センター及び放射線災害・医科学研究の学術基盤の確立，その成果の国民への還元，人材育成を通じて，放射線に関する社会貢献の進展を目指している。
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